Le calendrier de la phase préliminaire 2ème tour est conçu selon un tirage au sort. Participent à cette phase les vainqueurs du premier tour. Les matches se jouent en confrontation unique sur terrain neutre. En cas d’égalité après 90 minutes de temps règlementaires, il sera directement procédé à la séance des tirs aux buts. A l’issue de cette phase, 16 clubs seront qualifiés pour le 3ème tour qui verra la participation des clubs de la Ligue Nationale B.
Calendrier:
| Jour & Date | Journée | N° | Heure | Lieu | Equipes | Score | |
| Mardi | 26/01/2021 | 44 | 13h00 | St. Intwari | Pneu Mubimbi vs Burundi Pax | ||
| 38 | 15h30 | St. Intwari | UFD FC vs Deira Buyenzi | ||||
| 42 | 15h00 | St. Gatwaro | AS Vita Gasorwe vs Boca Junior Kirundo | ||||
| 36 | 13h00 | St.Urukundo | Amicale FC Kibimba vs Kayanza Star | ||||
| 39 | 15h30 | St.Urukundo | Rukinzo Ngozi vs Marine FC Ngozi | ||||
| Mercredi | 27/01/2021 | 2 | 45 | 13h00 | St. Ingoma | Lumière FC Mwaro vs SMS FC Bujumbura | |
| 32 | 15h30 | St. Ingoma | Eagle Academy Makamba vs Aigle Noir B | ||||
| 31 | 13h00 | St. Ivyizigiro | Academy Bururi vs Les Aiglons Academy | ||||
| 46 | 13h00 | St. Gatwaro | AS Kirundo vs JS Volontaire Kanyosha | ||||
| 41 | 15h30 | St. Gatwaro | Rukundo FC vs Young Star Muyinga | ||||
| Jeudi | 28/01/2021 | 43 | 13h00 | St. Ingoma | Moso City vs Muremera FC | ||
| 37 | 15h00 | C.T.N | Intore Rangers vs Jeca Regina Mundi | ||||
| 34 | 13h00 | St. Intwari | Rumonge City vs Fire FC Mabayi | ||||
| 33 | 15h30 | St. Intwari | Fidélité Rukaramu vs Amarago Wise Gitega | ||||
| 35 | 13h00 | St. Ruyigi | Karusi United vs Young Boys Rutegama | ||||
| 40 | 15h30 | St. Ruyigi | Les Jeunes Rapides Marenga vs Bururi City | ||||
